Averías varias

Si hace chispa lo unico que se me ocurre es que hayas variado el punto de encendido, que es cada dos vueltas de cigüeñal en una vuelta. Ojo, no tengo la seguridad en esta moto, pero si fuera asi te estaria dando la chispa en el cruce de valvulas, y no al final de la compresion. Antes de liarte a desmontar mira todo lo mas sencillo, empezando por lo de alimentar con pinzas que dice Mandroco, y que alguien te lo asegure y te diga, porque si fuera, a lo mejor solo tienes que mover algun enchufe, que yo en esta moto ni idea

Es que a veces, al poner el rotor, empujas sin darte cuenta la chaveta, está se sale pero queda pegada al imán. El problema es que te quedas sin la referencia para ponerlo, ahí que es probable que este fuera de punto.
Porque si hubieses apretado los cables al poner lesa tapa, no te haría chispa y está tenemos, aunque sea fuera de tiempo

si no toco las cadenas de tiempo la moto no tiene q variar su encendido con la posición del damper, asi no tenga la chaveta, si no le pone la chaveta el problema q tendrá sera para regular válvulas pues los puntos podrían estar en posiciones diferentes . si no enciende y tiene chispa revisar gasolina filtros etc etc.

en este caso no es así, ya que el tiempo de la chispa está dado por el pasaje de una parte imantada en el volante. Si pones corrido el volante, la chispa se produce, pero no en el tiempo justo.

cierto tienes razón la senal para el tci es desde el plato magnético.

Antes de nada, gracias a todos por la ayuda, me estais acojonando con la posible variación del encendido, espero que no sea eso.
La chaveta la quité y la puse tal y como estaba, tuve que darle calor para que soltara el plato con el extractor puesto, me costó bastante pero, al final salió. Hice fotografías, cambié el bendix y creo que puse todo en su sitio.
He medido otra vez las bobinas del alternador y todo correcto. Tambien he utilizado una batería de coche para asegurarme, pero sigue sin arrancar, solo hace el intento.
Como la chispa no era azulada he desmontado las bobinas y he medido el primario y el secundario, todo correcto dentro de los márgenes. Al soltar las pipas he visto que uno de los cables salió al instante y estaba ennegrecido, además la resistencia no es de 10Kh, como marca el manual, sino de 2 ohmios, ¿puede ser este el problema?

aqui recordando hay un conector del tci que es identico al de un relay y si se intercambia la moto no prende hahaha lo digo por experiencia, no se si has tocado eso. pero revisa que todos los conectores esten donde le corresponde y tambien algun cable haciendo mal contacto.

Pero. .. ¿ antes de desarmarla Funcionaba?